2018年1月2日，环保部官方公布了中央第八环境保护督察组对新疆维吾尔自治区（不含新疆生产建设兵团）的专员公署情况对系统，专员公署认为，新疆自治区生态环境保护工作虽然获得大力进展，但近年来经济发展过度倚赖能源资源研发，局部环境污染和生态毁坏问题更为引人注目，有的地方不存在伤害生态环境问题，部分区域污染管理工作过于有力。2017年8月11日至9月11日，中央第八环境保护督察组对新疆维吾尔自治区（不含新疆生产建设兵团）积极开展环境保护专员公署，并构成专员公署意见。

专员公署指出，新疆自治区和新疆兵团实施、研究了不准三低（高污染、高能耗、低废气）项目进疆的具体措施，关闭违法违规竣工或开建电解铝生产能力280万吨；实施能源、矿产资源研发一支笔审核制度，将各地州市所有能源、矿产资源研发审批权上缴，由自治区统一审核；修改新疆自治区环境保护条例、煤炭石油天然气研发环境保护条例等法规。但是有的地方和部门领导干部轻发展、重维护的观念没改变过来，指出新疆是经济欠发达地区，相结合煤炭、石油、矿产等资源优势减缓研发建设是大方向，过分特别强调环保不过于现实。还有一些同志指出，新疆地广人稀，沙漠戈壁多，环境承载力大，环境质量总体不俗，有点污染不更容易显出，会有什么大的影响。

在出局领先生产能力方面，新疆仍有归属于国家拒绝出局的生产能力没如期出局做到；在实施国家大气和水污染防治行动计划方面，不存在限制拒绝、放开标准的情况。例如，自治区发展改革委并未按国家拒绝真实情况请示违规电解铝生产能力，并未对电解铝清扫工作展开监督检查，导致东方期望80万吨和嘉润20万吨违规电解铝生产能力竣工并投产近2年；国土资源厅在自然保护区大量审核或沿袭矿权，2014年12月违规为吐鲁番金源矿冶公司维权铜矿沿袭矿权，在自然保护区构成2.3万平方米的矿坑，生态毁坏问题引人注目。

水利厅在2016年度水资源管理考核工作中避重就轻，并未将地下水用水量等2项最重要指标划入考核范畴。其次，局部区域大气和水环境问题引人注目。乌鲁木齐市2016年冬季采暖期可吸入颗粒物、粗颗粒物、氮氧化物平均值浓度较2014年大幅度下降。全市建成区燃煤小锅炉污染相当严重，米东区、高新区及水磨沟区杂乱污企业关闭整治不完全。

河东威立雅至今没建设除磷干氮设施，每天近10万吨微克污水排出老龙河。米东区政府及其涉及部门违规表示同意中德丰泉、河东威立雅将污泥长年灌入在北沙窝区域，不仅强占毁坏国家级公益林，而且带给环境污染和隐患。昌吉州部分县市继续执行锅炉尤其废气限值拒绝不做到，部分企业微克废气问题较多，2016年采暖期，辖昌吉市、阜康市可吸入颗粒物平均值浓度较2014年同期皆大幅度下降。

克拉玛依市艾里克湖是自治区2015年批准后的生态环境保护试点湖泊，但列为试点的管理工程进度迟缓，底泥筑堤、围栏禁牧等9个项目至今仍未发布命令资金，严重影响水质提高。在入湖水量减少近1倍的情况下，湖泊水质仍由2014年Ⅴ类上升为2016年劣Ⅴ类。巴州博斯腾湖列为国家较好湖泊生态维护试点，但涉及管理项目进展较慢，博湖县、大河口景区等污水处理厂或微克废气或不长时间运营，湖泊水质没超过预期管理目标。

乌鲁木齐市柴窝堡湖周边长年超采地下水，严重影响湖泊补水，造成湖面面积大幅增大。此外，有的地方不存在伤害生态环境问题。2013年以来，博州国投公司入股博艾丰生物制品公司违规在艾比湖国家级自然保护区核心区开凿沟渠，捕鱼卤虫，并获得收益；博州水利局违规为博艾丰生物制品公司派发捕鱼许可证，缴纳渔业资源电子货币保护费。

矿山环境完全恢复管理迟缓，全区已紧坑的矿山和政策性重开的小煤矿、砂石粘土矿等矿山毁坏面积超过2165平方公里，截至目前仅有已完成管理面积3.77%。吐鲁番市艾维尔沟、昌吉州硫磺沟等地贪采滥凿问题引人注目，生态完全恢复相当严重迟缓。另外，新疆水资源极为紧缺，但对国家地下水禁采、限采拒绝实施不力。乌鲁木齐市米东区2016年2月被划界为地下水相当严重超采区，但截至2017年7月，米东区仍有91家工业企业的149眼采买水井铁矿地下水，大量提取地下水造成该区域地下水位经常出现上升。

巴州库尔勒市建成区2014年9月被划界为地下水严禁采区后，到目前为止，禁采规定仍没落到实处，2016年地下水水位较2013年仅次于上升2.18米，对全市生态环境包含较小威胁。最后，一些地方引人注目环境问题没获得彻底解决。

乌鲁木齐米东化工工业园区19家钢铁铸企业，11家无环保申请、4家无污染管理设施。昌吉州呼图壁天山工业园区至今并未按拒绝竣工污水处理厂，园区多家企业长年将污水违法排出园区外渗坑。乌拉泊饮用水源是乌鲁木齐市主要地表饮用水水源地，但2013年以来，市政府及其发展改革、规划等部门先后批准后乌拉泊污水处理厂选址并建设在该饮用水水源二级保护区，并在其内设置排污口，对水源安全性带给严重威胁。

专员公署同时认为，新疆兵团有些师市环境保护主体责任实施过于做到，管理机制尚能不完善，局部地区生态环境问题更为引人注目。兵团发展改革委并未将伊犁黑蜂自然保护区内的煤矿列为2016至2020年煤炭生产能力解散表格；工信委出局领先生产能力工作不力，哈密亿艺焦化公司2台5万吨/年兰炭生产装置按拒绝订于2012年底前出局，但至今仍并未出局做到；国土、旅游等部门2013年后仍在自然保护区内违规审核水电站、旅游等项目；林业局对自然保护区的日常管理相当严重缺位，对保护区大量不存在违法违规项目不监管、不阻止。

部分区域污染管理工作过于有力。石河子市近年来相继竣工一大批能源化工企业，区域结构性污染问题日益突出。2014年后仍违规新建36台每小时10蒸吨以下燃煤锅炉；城中村大量暖气小锅炉冬季污染问题引人注目。

2016年全市空气优良率较上年同比上升5.8%，2017年上半年粗颗粒物平均值浓度同比下降30%。五家渠市近年来火电装机、电解铝生产能力快速增长较慢，煤炭消耗量持续增长。2016年，全市空气优良率较上年上升10.4%，2017年上半年粗颗粒物平均值浓度同比下降12.5%。另外，蘑菇湖水库主要采纳石河子市生活污水和工业废水，但石河子市2015年计划建设的市污水处理厂提标改建和中水返用工程，直到专员公署入驻前才动工建设；城市污水搜集管网不完备，每天大约6万吨生活污水无法处置直排环境；市化工新材料产业园中水返用设施没能发挥作用，每天大约4000吨工业废水直排水库。

正是由于涉及管理工作较慢，造成蘑菇湖水库水质2013年以来持续为劣Ⅴ类。还有一些引人注目环境问题长年没获得解决问题。新疆兵团4个省级自然保护区违法违规建设研发问题较多，奎屯河流域湿地省级自然保护区内有17座水电站在违规生产；永安坝湿地生态旅游区坐落于叶尔羌河中下游湿地省级自然保护区内，已违规竣工码头、木栈道等设施。4家棉浆粕及粘胶纤维企业并未按拒绝积极开展纳污库无害化管理工作，其中阿拉尔市富丽约纤维有限公司生产废水违规排出纳污库，导致周边环境污染。

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